核酸结果 Tier B · benchmark_suite
有公开数值结果DNALongBench
Long-range genomic tasks; exact sequence length and cell-type packaging vary by track.
B07community_protocolnot_applicable
结果覆盖
6 条结果, 2 个协议
- 主来源覆盖
- primary_sources_screened
- 相关工作覆盖
- index_screen_complete
- 权威性准备度
- discovery_only
- 文献截止
- 2026-08-06
| Track | 数值覆盖 | 来源闭环 | 阻塞原因 |
|---|
B07-TR01 DNALongBench — Chromatin accessibility prediction | numeric_results_available 0 results | closed_no_eligible_public_numeric_result | no_eligible_public_numeric_result |
B07-TR02 DNALongBench — Histone-mark prediction | numeric_results_available 0 results | closed_no_eligible_public_numeric_result | no_eligible_public_numeric_result |
B07-TR03 DNALongBench — 3D genome contact prediction | numeric_results_available 1 results | closed_with_numeric_evidence | NR |
B07-TR04 DNALongBench — Sequence-to-gene-expression prediction | numeric_results_available 5 results | closed_with_numeric_evidence | NR |
协议级结果
先选口径,再比较分数。
每个卡片仅展示同一 protocol + metric fingerprint 的四类声明。
transcription initiation signal prediction; average across five assays · held-out chromosomes 8 and 9 · paper-defined held-out evaluation
Pearson rpaper-defined held-out Pearson correlation · 5 条结果
官方 baseline
Caduceus-Ph;Caduceus-PS;CNN;HyenaDNA medium-450k;Puffin-D0.109 / 0.108 / 0.042 / 0.132 / 0.733Pearson r · fraction证据 ↗原论文表内最佳
Puffin-D0.733Pearson r · fraction证据 ↗官方榜单 / 挑战领先者
未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。严格跨工作 SOTA
未建立该类声明不会用表内最佳值代替跨工作 SOTA。指纹: PMF-v1-9AC09D8D0BBEA2E636B4EE04
contact-map prediction; five primary cell lines · held-out test set · paper-defined held-out evaluation
SCCstratum-adjusted correlation coefficient · 1 条结果
官方 baseline
Akita0.233SCC · fraction证据 ↗原论文表内最佳
未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。官方榜单 / 挑战领先者
未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。严格跨工作 SOTA
未建立该类声明不会用表内最佳值代替跨工作 SOTA。指纹: PMF-v1-15D254AF2D9FBEA0CA05D4FE