Tier B · benchmark_suite

有公开数值结果

DNALongBench

Long-range genomic tasks; exact sequence length and cell-type packaging vary by track.

B07community_protocolnot_applicable

结果覆盖

6 条结果, 2 个协议

主来源覆盖
primary_sources_screened
相关工作覆盖
index_screen_complete
权威性准备度
discovery_only
文献截止
2026-08-06
Track数值覆盖来源闭环阻塞原因
B07-TR01
DNALongBench — Chromatin accessibility prediction
numeric_results_available
0 results
closed_no_eligible_public_numeric_resultno_eligible_public_numeric_result
B07-TR02
DNALongBench — Histone-mark prediction
numeric_results_available
0 results
closed_no_eligible_public_numeric_resultno_eligible_public_numeric_result
B07-TR03
DNALongBench — 3D genome contact prediction
numeric_results_available
1 results
closed_with_numeric_evidenceNR
B07-TR04
DNALongBench — Sequence-to-gene-expression prediction
numeric_results_available
5 results
closed_with_numeric_evidenceNR

协议级结果

先选口径,再比较分数。

每个卡片仅展示同一 protocol + metric fingerprint 的四类声明。

序列到基因表达预测 · B07-TR04 · same_source_table

DNALongBench — Sequence-to-gene-expression prediction

完整结果 →

transcription initiation signal prediction; average across five assays · held-out chromosomes 8 and 9 · paper-defined held-out evaluation

Pearson rpaper-defined held-out Pearson correlation · 5 条结果

官方 baseline

Caduceus-Ph;Caduceus-PS;CNN;HyenaDNA medium-450k;Puffin-D0.109 / 0.108 / 0.042 / 0.132 / 0.733Pearson r · fraction证据 ↗

原论文表内最佳

Puffin-D0.733Pearson r · fraction证据 ↗

官方榜单 / 挑战领先者

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

严格跨工作 SOTA

未建立该类声明不会用表内最佳值代替跨工作 SOTA。

指纹: PMF-v1-9AC09D8D0BBEA2E636B4EE04

染色质三维接触预测 · B07-TR03 · same_source_table

DNALongBench — 3D genome contact prediction

完整结果 →

contact-map prediction; five primary cell lines · held-out test set · paper-defined held-out evaluation

SCCstratum-adjusted correlation coefficient · 1 条结果

官方 baseline

Akita0.233SCC · fraction证据 ↗

原论文表内最佳

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

官方榜单 / 挑战领先者

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

严格跨工作 SOTA

未建立该类声明不会用表内最佳值代替跨工作 SOTA。

指纹: PMF-v1-15D254AF2D9FBEA0CA05D4FE