Tier B · benchmark_suite

有公开数值结果

BEACON

Thirteen native tasks; some reuse OpenVaccine, Optimus and CRISPR datasets.

B09community_protocolnot_applicable

结果覆盖

221 条结果, 13 个协议

主来源覆盖
primary_sources_screened
相关工作覆盖
priority_systematic_search_complete
权威性准备度
verified_for_internal_use
文献截止
2026-08-06
Track数值覆盖来源闭环阻塞原因
B09-TR01
BEACON — RNA secondary-structure base-pair prediction
numeric_results_available
34 results
closed_with_numeric_evidenceNR
B09-TR02
BEACON — RNA contact or distance-map prediction
numeric_results_available
17 results
closed_with_numeric_evidenceNR
B09-TR03
BEACON — RNA probing-reactivity prediction
numeric_results_available
17 results
closed_with_numeric_evidenceNR
B09-TR04
BEACON — Splice-site prediction
numeric_results_available
17 results
closed_with_numeric_evidenceNR
B09-TR05
BEACON — Alternative polyadenylation quantification
numeric_results_available
17 results
closed_with_numeric_evidenceNR
B09-TR06
BEACON — ncRNA family classification
numeric_results_available
17 results
closed_with_numeric_evidenceNR
B09-TR07
BEACON — RNA modification-site prediction
numeric_results_available
17 results
closed_with_numeric_evidenceNR
B09-TR08
BEACON — Translation efficiency or ribosome-load prediction
numeric_results_available
17 results
closed_with_numeric_evidenceNR
B09-TR09
BEACON — RNA degradation and vaccine-stability prediction
numeric_results_available
17 results
closed_with_numeric_evidenceNR
B09-TR10
BEACON — Programmable RNA-switch function prediction
numeric_results_available
17 results
closed_with_numeric_evidenceNR
B09-TR11
BEACON — CRISPR guide on-target design
numeric_results_available
17 results
closed_with_numeric_evidenceNR
B09-TR12
BEACON — CRISPR guide off-target design
numeric_results_available
17 results
closed_with_numeric_evidenceNR

协议级结果

先选口径,再比较分数。

每个卡片仅展示同一 protocol + metric fingerprint 的四类声明。

RNA 二级结构配对预测 · B09-TR01 · same_source_table

SSP

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SSP · official train/validation/test split · full fine-tuning for BERT-like RNA LMs; official baseline setup

F1binary · 17 条结果

官方 baseline

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

原论文表内最佳

RNA-FM0.685F1 · fraction证据 ↗

官方榜单 / 挑战领先者

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

严格跨工作 SOTA

未建立该类声明不会用表内最佳值代替跨工作 SOTA。

指纹: PMF-v1-11F3C2F05D3765DD38CCB2BE

RNA 接触/距离图预测 · B09-TR02 · same_source_table

CMP

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CMP · official train/validation/test split · full fine-tuning for BERT-like RNA LMs; official baseline setup

P@Lcontact prediction · 17 条结果

官方 baseline

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

原论文表内最佳

BEACON-B5120.612P@L · fraction证据 ↗

官方榜单 / 挑战领先者

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

严格跨工作 SOTA

未建立该类声明不会用表内最佳值代替跨工作 SOTA。

指纹: PMF-v1-7DE315964061D7CBFF53C6DF

RNA 结构探针反应性预测 · B09-TR03 · same_source_table

DMP

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DMP · official train/validation/test split · full fine-tuning for BERT-like RNA LMs; official baseline setup

coefficient of determination · 17 条结果

官方 baseline

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

原论文表内最佳

BEACON-B5120.5682R² · fraction证据 ↗

官方榜单 / 挑战领先者

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

严格跨工作 SOTA

未建立该类声明不会用表内最佳值代替跨工作 SOTA。

指纹: PMF-v1-D65649B0ADEB7DB8A73DD55E

RNA 二级结构配对预测 · B09-TR01 · same_source_table

SSI

完整结果 →

SSI · official train/validation/test split · full fine-tuning for BERT-like RNA LMs; official baseline setup

coefficient of determination · 17 条结果

官方 baseline

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

原论文表内最佳

RNA-FM0.4236R² · fraction证据 ↗

官方榜单 / 挑战领先者

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

严格跨工作 SOTA

未建立该类声明不会用表内最佳值代替跨工作 SOTA。

指纹: PMF-v1-F46220E46265671267C34BA2

剪接位点识别 · B09-TR04 · same_source_table

SPL

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SPL · official train/validation/test split · full fine-tuning for BERT-like RNA LMs; official baseline setup

ACC@Ktop-K accuracy · 17 条结果

官方 baseline

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

原论文表内最佳

Splice-MS5100.5055ACC@K · fraction证据 ↗

官方榜单 / 挑战领先者

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

严格跨工作 SOTA

未建立该类声明不会用表内最佳值代替跨工作 SOTA。

指纹: PMF-v1-8F93B5DB293C785E3C145950

可变加尾定量 · B09-TR05 · same_source_table

APA

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APA · official train/validation/test split · full fine-tuning for BERT-like RNA LMs; official baseline setup

coefficient of determination · 17 条结果

官方 baseline

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

原论文表内最佳

UTRBERT-4mer0.7271R² · fraction证据 ↗

官方榜单 / 挑战领先者

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

严格跨工作 SOTA

未建立该类声明不会用表内最佳值代替跨工作 SOTA。

指纹: PMF-v1-EBD0D882A306F188559DA397

非编码 RNA 家族分类 · B09-TR06 · same_source_table

NcRNA

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NcRNA · official train/validation/test split · full fine-tuning for BERT-like RNA LMs; official baseline setup

Accuracyclassification · 17 条结果

官方 baseline

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

原论文表内最佳

RNA-FM0.9681Accuracy · fraction证据 ↗

官方榜单 / 挑战领先者

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

严格跨工作 SOTA

未建立该类声明不会用表内最佳值代替跨工作 SOTA。

指纹: PMF-v1-00E960A8D8262B6DDD7F2E75

RNA 修饰位点预测 · B09-TR07 · same_source_table

Modif

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Modif · official train/validation/test split · full fine-tuning for BERT-like RNA LMs; official baseline setup

AUROCclassification · 17 条结果

官方 baseline

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

原论文表内最佳

UTRBERT-3mer0.9514AUROC · fraction证据 ↗

官方榜单 / 挑战领先者

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

严格跨工作 SOTA

未建立该类声明不会用表内最佳值代替跨工作 SOTA。

指纹: PMF-v1-35DA7A81E1849F1E3859741B

翻译效率/核糖体负载预测 · B09-TR08 · same_source_table

MRL

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MRL · official train/validation/test split · full fine-tuning for BERT-like RNA LMs; official baseline setup

coefficient of determination · 17 条结果

官方 baseline

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

原论文表内最佳

Splice-MS5100.8498R² · fraction证据 ↗

官方榜单 / 挑战领先者

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

严格跨工作 SOTA

未建立该类声明不会用表内最佳值代替跨工作 SOTA。

指纹: PMF-v1-9EA295D7EE86D044AEB0BFBD

RNA 降解/疫苗稳定性预测 · B09-TR09 · same_source_table

VDP

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VDP · official train/validation/test split · full fine-tuning for BERT-like RNA LMs; official baseline setup

MCRMSEmulti-column RMSE · 17 条结果

官方 baseline

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

原论文表内最佳

Splice-MS10240.313MCRMSE · raw证据 ↗

官方榜单 / 挑战领先者

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

严格跨工作 SOTA

未建立该类声明不会用表内最佳值代替跨工作 SOTA。

指纹: PMF-v1-DBF811A8F3504CF49BA29EC3

可编程 RNA 开关功能预测 · B09-TR10 · same_source_table

PRS

完整结果 →

PRS · official train/validation/test split · full fine-tuning for BERT-like RNA LMs; official baseline setup

coefficient of determination · 17 条结果

官方 baseline

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

原论文表内最佳

Splice-MS10240.5772R² · fraction证据 ↗

官方榜单 / 挑战领先者

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

严格跨工作 SOTA

未建立该类声明不会用表内最佳值代替跨工作 SOTA。

指纹: PMF-v1-251A42653730B4EE237E2D78

CRISPR 向导 RNA 靶向效率设计 · B09-TR11 · same_source_table

CRI-On

完整结果 →

CRI-On · official train/validation/test split · full fine-tuning for BERT-like RNA LMs; official baseline setup

Spearman ρrank correlation · 17 条结果

官方 baseline

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

原论文表内最佳

RNA-MSM0.3492Spearman ρ · fraction证据 ↗

官方榜单 / 挑战领先者

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

严格跨工作 SOTA

未建立该类声明不会用表内最佳值代替跨工作 SOTA。

指纹: PMF-v1-A4BEAECD3FC62C85E6D28EFC

CRISPR 脱靶风险设计 · B09-TR12 · same_source_table

CRI-Off

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CRI-Off · official train/validation/test split · full fine-tuning for BERT-like RNA LMs; official baseline setup

Spearman ρrank correlation · 17 条结果

官方 baseline

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

原论文表内最佳

ResNet0.115Spearman ρ · fraction证据 ↗

官方榜单 / 挑战领先者

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

严格跨工作 SOTA

未建立该类声明不会用表内最佳值代替跨工作 SOTA。

指纹: PMF-v1-59245AB58779E53AF0996E96