Tier C · benchmark_suite

有公开数值结果

RNA–RNA Interactions Benchmark

Manually confirmed interaction regions across archaea, bacteria and eukaryotes; the repository moved from UCanCompBio to Gardner-BinfLab.

结果覆盖

84 条结果， 7 个协议

主来源覆盖: primary_displayed_tables_complete
相关工作覆盖: index_screen_complete_with_logged_api_limits
权威性准备度: usable_with_caveats
文献截止: 2026-08-06

Track	数值覆盖	来源闭环	阻塞原因
`B40-TR01` RNA–RNA Interactions Benchmark — RNA–RNA interaction prediction	numeric_results_available 84 results	closed_with_numeric_evidence	NR

协议级结果

先选口径，再比较分数。

每个卡片仅展示同一 protocol + metric fingerprint 的四类声明。

RNA–RNA 相互作用预测 · B40-TR01 · same_source_table

direct interaction-region prediction

完整结果 →

runtime on selected files (n=50) · selected files (n=50) · task-specific evaluation

Runtimewall-clock on selected files · 15 条结果

官方 baseline

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

原论文表内最佳

RIsearch4.16Runtime · seconds证据 ↗

官方榜单 / 挑战领先者

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

严格跨工作 SOTA

未建立该类声明不会用表内最佳值代替跨工作 SOTA。

指纹: PMF-v1-3CA7F24A71A95C6F139F77C1

RNA–RNA 相互作用预测 · B40-TR01 · same_source_table

direct interaction-region prediction

完整结果 →

sensitivity · selected files (n=50) · task-specific evaluation

True positive ratesensitivity · 15 条结果

官方 baseline

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

原论文表内最佳

RNAduplex0.66True positive rate · fraction证据 ↗

官方榜单 / 挑战领先者

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

严格跨工作 SOTA

未建立该类声明不会用表内最佳值代替跨工作 SOTA。

指纹: PMF-v1-B5F8BC535D9CB46532469147

RNA–RNA 相互作用预测 · B40-TR01 · same_source_table

direct interaction-region prediction

完整结果 →

precision · selected files (n=50) · task-specific evaluation

Positive predictive valueprecision · 15 条结果

官方 baseline

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

原论文表内最佳

RNAup0.69Positive predictive value · fraction证据 ↗

官方榜单 / 挑战领先者

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

严格跨工作 SOTA

未建立该类声明不会用表内最佳值代替跨工作 SOTA。

指纹: PMF-v1-62599CABF6ECB49ABC377E6F

RNA–RNA 相互作用预测 · B40-TR01 · same_source_table

direct interaction-region prediction

完整结果 →

MCC · selected files (n=50) · task-specific evaluation

Matthews correlation coefficientclassification · 15 条结果

官方 baseline

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

原论文表内最佳

RNAup0.6Matthews correlation coefficient · fraction证据 ↗

官方榜单 / 挑战领先者

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

严格跨工作 SOTA

未建立该类声明不会用表内最佳值代替跨工作 SOTA。

指纹: PMF-v1-456AB72A26D20E58AD5035CA

RNA–RNA 相互作用预测 · B40-TR01 · same_source_table

native-interaction ranking

完整结果 →

Total # of significant (P < 0.05) correct predictions for Gumbel dist. (n = 60) · 60 interactions · task-specific evaluation

Significant correct predictionsP<0.05 · 8 条结果

官方 baseline

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

原论文表内最佳

RNAup28Significant correct predictions · count证据 ↗

官方榜单 / 挑战领先者

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

严格跨工作 SOTA

未建立该类声明不会用表内最佳值代替跨工作 SOTA。

指纹: PMF-v1-C6C9BA9F98C320D270E4E2B0

RNA–RNA 相互作用预测 · B40-TR01 · same_source_table

native-interaction ranking

完整结果 →

Total # of significant (P < 0.05) correct predictions for normal dist. (n = 60) · 60 interactions · task-specific evaluation

Significant correct predictionsP<0.05 · 8 条结果

官方 baseline

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

原论文表内最佳

RNAplex30Significant correct predictions · count证据 ↗

官方榜单 / 挑战领先者

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

严格跨工作 SOTA

未建立该类声明不会用表内最佳值代替跨工作 SOTA。

指纹: PMF-v1-6A4FACBC9F10C9BB899419A4

RNA–RNA 相互作用预测 · B40-TR01 · same_source_table

native-interaction ranking

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Median rank of native interactions · 60 interactions · task-specific evaluation

Median native-interaction ranknative interactions · 8 条结果

官方 baseline

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

原论文表内最佳

RNAplex10.5Median native-interaction rank · rank证据 ↗

官方榜单 / 挑战领先者

未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。

严格跨工作 SOTA

未建立该类声明不会用表内最佳值代替跨工作 SOTA。

指纹: PMF-v1-FA61529DFFD39C9144628CF6