Tier C · benchmark_suite
有公开数值结果One-time benchmark study rather than a maintained benchmark suite.
结果覆盖
| Track | 数值覆盖 | 来源闭环 | 阻塞原因 |
|---|---|---|---|
B08-TR01Benchmarking DNA foundation models for genomic and genetic tasks — Genomic element classification | numeric_results_available 0 results | closed_no_eligible_public_numeric_result | no_eligible_public_numeric_result |
B08-TR02Benchmarking DNA foundation models for genomic and genetic tasks — Promoter recognition | numeric_results_available 0 results | closed_no_eligible_public_numeric_result | no_eligible_public_numeric_result |
B08-TR03Benchmarking DNA foundation models for genomic and genetic tasks — TF binding-site prediction | numeric_results_available 0 results | closed_no_eligible_public_numeric_result | no_eligible_public_numeric_result |
B08-TR04Benchmarking DNA foundation models for genomic and genetic tasks — Splice-site prediction | numeric_results_available 2 results | closed_with_numeric_evidence | NR |
B08-TR05Benchmarking DNA foundation models for genomic and genetic tasks — Regulatory variant-effect prediction | numeric_results_available 4 results | closed_with_numeric_evidence | NR |
B08-TR06Benchmarking DNA foundation models for genomic and genetic tasks — Molecular functional or pathogenic variant interpretation | numeric_results_available 2 results | closed_with_numeric_evidence | NR |
协议级结果
每个卡片仅展示同一 protocol + metric fingerprint 的四类声明。
剪接位点识别 · B08-TR04 · same_source_table
splice donor identification · paper-defined held-out test split · paper-defined held-out evaluation
官方 baseline
未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。原论文表内最佳
未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。官方榜单 / 挑战领先者
未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。严格跨工作 SOTA
未建立该类声明不会用表内最佳值代替跨工作 SOTA。指纹: PMF-v1-683B5992FB2043C2179E8E05
剪接位点识别 · B08-TR04 · same_source_table
splice acceptor identification · paper-defined held-out test split · paper-defined held-out evaluation
官方 baseline
未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。原论文表内最佳
未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。官方榜单 / 挑战领先者
未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。严格跨工作 SOTA
未建立该类声明不会用表内最佳值代替跨工作 SOTA。指纹: PMF-v1-26C8D1580FB51539367BC138
分子功能性/致病变异解释 · B08-TR06 · same_source_table
pathogenic versus common SNP · nested chromosome-based held-out test groups · paper-defined held-out evaluation
官方 baseline
未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。原论文表内最佳
Nucleotide Transformer v20.73AUROC · fraction证据 ↗官方榜单 / 挑战领先者
未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。严格跨工作 SOTA
未建立该类声明不会用表内最佳值代替跨工作 SOTA。指纹: PMF-v1-7AA4F4DD18F6A98FD71357EB
调控变异效应预测 · B08-TR05 · same_source_table
putative causal sQTL · nested chromosome-based held-out test groups · paper-defined held-out evaluation
官方 baseline
未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。原论文表内最佳
未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。官方榜单 / 挑战领先者
未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。严格跨工作 SOTA
未建立该类声明不会用表内最佳值代替跨工作 SOTA。指纹: PMF-v1-C66A17D570014B8F17BC4007
调控变异效应预测 · B08-TR05 · same_source_table
putative causal ipaQTL · nested chromosome-based held-out test groups · paper-defined held-out evaluation
官方 baseline
未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。原论文表内最佳
未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。官方榜单 / 挑战领先者
未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。严格跨工作 SOTA
未建立该类声明不会用表内最佳值代替跨工作 SOTA。指纹: PMF-v1-501F080104806EB4073AEC3E
调控变异效应预测 · B08-TR05 · same_source_table
putative causal eQTL · nested chromosome-based held-out test groups · paper-defined held-out evaluation
官方 baseline
未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。原论文表内最佳
Enformer0.77AUROC · fraction证据 ↗官方榜单 / 挑战领先者
未建立该类声明当前快照没有符合口径的结果。严格跨工作 SOTA
未建立该类声明不会用表内最佳值代替跨工作 SOTA。指纹: PMF-v1-9B3D9A02DE958A097E88E22C